《憤怒的菩薩》改編自日籍台裔小說家陳舜臣的同名小說，這部小說是陳舜臣唯一一部以台灣為場景的長篇推理小說。書中如實呈現了戰後初期台灣社會的樣貌，以及在歷史夾縫中求生存、努力適應政權交替的台灣人民的心聲。生活在台灣這塊土地上的人們，無可奈何地深陷在時代洪流中，五十年前先是被迫成為「日本人」，戰後在一夕之間變成「中國人」，連「國語」都需從頭學起。然而，倒底何謂中國人呢？陳舜臣為所有對這份哀傷產生共鳴的人們，寫出了屬於他們的故事。 本劇內容敘述楊輝銘（巫建和飾）與陶展文（吳慷仁飾）兩人二戰後從日本返台，暫時落腳在輝銘的未婚妻林彩琴家鄉菩薩庄，卻意外撞見命案。1946年的敏感時期，曾經協助日本的有力人士皆被視為「漢奸」，仍留在台灣的日本軍官川崎少佐此時卻被殺害。林彩琴的哥哥林景維與其世交陸宙之前赴大陸投身抗日組織，傳言兩人已死。在川崎少佐被殺害後，林景維竟然現身，死而復生。推理能力過人的陶展文開始調查，未料掀開背後更大的秘密……。故事以彩琴出身的林家及當地另一望族陸家為焦點開展調查過程，兩人在破案同時卻挑動當時國民政府、台灣民眾、日本軍隊三方錯綜複雜的利益關係與敏感神經。